MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. APS (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 17422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002528	TTTAA	2	10	200	209	40 %	60 %	0 %	0 %	15616631
2	NC_002528	GTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
3	NC_002528	AGC	2	6	256	261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616631
4	NC_002528	TCA	2	6	269	274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
5	NC_002528	ATT	2	6	292	297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616631
6	NC_002528	CTCA	2	8	299	306	25 %	25 %	0 %	50 %	15616631
7	NC_002528	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
8	NC_002528	GGT	2	6	395	400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616631
9	NC_002528	ATG	2	6	401	406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616631
10	NC_002528	CTG	2	6	465	470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616631
11	NC_002528	CTA	2	6	477	482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
12	NC_002528	A	8	8	520	527	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
13	NC_002528	A	6	6	532	537	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
14	NC_002528	AAT	2	6	542	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616631
15	NC_002528	TGT	2	6	598	603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
16	NC_002528	GT	3	6	606	611	0 %	50 %	50 %	0 %	15616631
17	NC_002528	AATT	2	8	625	632	50 %	50 %	0 %	0 %	15616631
18	NC_002528	AGC	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616631
19	NC_002528	T	6	6	667	672	0 %	100 %	0 %	0 %	15616631
20	NC_002528	AGG	2	6	673	678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15616631
21	NC_002528	CTG	2	6	708	713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616631
22	NC_002528	CGC	2	6	798	803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15616631
23	NC_002528	TTA	2	6	839	844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616631
24	NC_002528	T	6	6	873	878	0 %	100 %	0 %	0 %	15616631
25	NC_002528	CAT	2	6	899	904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
26	NC_002528	CA	3	6	928	933	50 %	0 %	0 %	50 %	15616631
27	NC_002528	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
28	NC_002528	ATA	2	6	956	961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616631
29	NC_002528	AT	3	6	986	991	50 %	50 %	0 %	0 %	15616631
30	NC_002528	T	6	6	997	1002	0 %	100 %	0 %	0 %	15616631
31	NC_002528	TAG	2	6	1167	1172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616631
32	NC_002528	T	7	7	1234	1240	0 %	100 %	0 %	0 %	15616631
33	NC_002528	ATTA	2	8	1276	1283	50 %	50 %	0 %	0 %	15616631
34	NC_002528	T	6	6	1292	1297	0 %	100 %	0 %	0 %	15616631
35	NC_002528	ACT	2	6	1316	1321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
36	NC_002528	GAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616631
37	NC_002528	TTG	2	6	1349	1354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
38	NC_002528	GCA	2	6	1367	1372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15616631
39	NC_002528	GAT	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616631
40	NC_002528	ACT	2	6	1448	1453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
41	NC_002528	CTTT	2	8	1505	1512	0 %	75 %	0 %	25 %	15616631
42	NC_002528	AGA	2	6	1516	1521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616631
43	NC_002528	A	9	9	1636	1644	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
44	NC_002528	A	7	7	1681	1687	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
45	NC_002528	TA	3	6	1689	1694	50 %	50 %	0 %	0 %	15616631
46	NC_002528	TTAAT	2	10	1698	1707	40 %	60 %	0 %	0 %	15616631
47	NC_002528	ATT	2	6	1729	1734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616631
48	NC_002528	TTG	2	6	1794	1799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
49	NC_002528	AGA	2	6	1864	1869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616631
50	NC_002528	A	6	6	1885	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
51	NC_002528	ATC	2	6	1906	1911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616631
52	NC_002528	TCT	2	6	1943	1948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616631
53	NC_002528	GTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616631
54	NC_002528	A	6	6	1958	1963	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
55	NC_002528	GCT	2	6	2024	2029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616631
56	NC_002528	TTA	2	6	2039	2044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616631
57	NC_002528	A	7	7	2053	2059	100 %	0 %	0 %	0 %	15616631
58	NC_002528	AT	3	6	2310	2315	50 %	50 %	0 %	0 %	15616632
59	NC_002528	TCA	2	6	2319	2324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616632
60	NC_002528	AGAT	2	8	2339	2346	50 %	25 %	25 %	0 %	15616632
61	NC_002528	ATT	2	6	2362	2367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616632
62	NC_002528	TCT	2	6	2383	2388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616632
63	NC_002528	ATT	2	6	2390	2395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616632
64	NC_002528	T	7	7	2419	2425	0 %	100 %	0 %	0 %	15616632
65	NC_002528	T	9	9	2442	2450	0 %	100 %	0 %	0 %	15616632
66	NC_002528	T	6	6	2456	2461	0 %	100 %	0 %	0 %	15616632
67	NC_002528	A	8	8	2472	2479	100 %	0 %	0 %	0 %	15616632
68	NC_002528	TATT	2	8	2603	2610	25 %	75 %	0 %	0 %	15616632
69	NC_002528	T	7	7	2615	2621	0 %	100 %	0 %	0 %	15616632
70	NC_002528	GATT	2	8	2646	2653	25 %	50 %	25 %	0 %	15616632
71	NC_002528	ATTT	2	8	2661	2668	25 %	75 %	0 %	0 %	15616632
72	NC_002528	CTG	2	6	2711	2716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616632
73	NC_002528	ATATTA	2	12	2717	2728	50 %	50 %	0 %	0 %	15616632
74	NC_002528	T	8	8	2752	2759	0 %	100 %	0 %	0 %	15616632
75	NC_002528	ATTTT	2	10	2761	2770	20 %	80 %	0 %	0 %	15616632
76	NC_002528	ATT	2	6	2910	2915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616632
77	NC_002528	TTTTA	2	10	2943	2952	20 %	80 %	0 %	0 %	15616632
78	NC_002528	TGC	2	6	2963	2968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15616632
79	NC_002528	TGG	2	6	2971	2976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616632
80	NC_002528	T	6	6	2985	2990	0 %	100 %	0 %	0 %	15616632
81	NC_002528	TAA	2	6	3020	3025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616632
82	NC_002528	TTTTAT	2	12	3039	3050	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	15616632
83	NC_002528	TA	3	6	3166	3171	50 %	50 %	0 %	0 %	15616633
84	NC_002528	TGG	2	6	3185	3190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15616633
85	NC_002528	GGAATT	2	12	3217	3228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616633
86	NC_002528	ATT	2	6	3279	3284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616633
87	NC_002528	T	6	6	3295	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	15616633
88	NC_002528	TA	3	6	3353	3358	50 %	50 %	0 %	0 %	15616633
89	NC_002528	AT	3	6	3565	3570	50 %	50 %	0 %	0 %	15616634
90	NC_002528	CCT	2	6	3575	3580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15616634
91	NC_002528	ATT	2	6	3581	3586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616634
92	NC_002528	A	7	7	3637	3643	100 %	0 %	0 %	0 %	15616634
93	NC_002528	TA	3	6	3657	3662	50 %	50 %	0 %	0 %	15616634
94	NC_002528	A	9	9	3669	3677	100 %	0 %	0 %	0 %	15616634
95	NC_002528	ATT	2	6	3689	3694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616634
96	NC_002528	CAAA	2	8	3700	3707	75 %	0 %	0 %	25 %	15616634
97	NC_002528	AGA	2	6	3757	3762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616634
98	NC_002528	AGA	2	6	3781	3786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616634
99	NC_002528	A	7	7	3791	3797	100 %	0 %	0 %	0 %	15616634
100	NC_002528	AGT	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616634
101	NC_002528	A	6	6	3894	3899	100 %	0 %	0 %	0 %	15616634
102	NC_002528	A	8	8	3905	3912	100 %	0 %	0 %	0 %	15616634
103	NC_002528	GAT	2	6	3923	3928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616634
104	NC_002528	GTT	2	6	3937	3942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616634
105	NC_002528	CTT	2	6	3957	3962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616634
106	NC_002528	AAT	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616635
107	NC_002528	AT	3	6	4070	4075	50 %	50 %	0 %	0 %	15616635
108	NC_002528	TTA	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616635
109	NC_002528	A	6	6	4105	4110	100 %	0 %	0 %	0 %	15616635
110	NC_002528	T	6	6	4119	4124	0 %	100 %	0 %	0 %	15616635
111	NC_002528	TGA	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616635
112	NC_002528	A	6	6	4200	4205	100 %	0 %	0 %	0 %	15616635
113	NC_002528	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616635
114	NC_002528	ATT	2	6	4215	4220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616635
115	NC_002528	AT	3	6	4241	4246	50 %	50 %	0 %	0 %	15616635
116	NC_002528	ATA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616635
117	NC_002528	CAT	2	6	4296	4301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616635
118	NC_002528	TTC	2	6	4375	4380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15616635
119	NC_002528	A	8	8	4383	4390	100 %	0 %	0 %	0 %	15616635
120	NC_002528	TA	4	8	4398	4405	50 %	50 %	0 %	0 %	15616635
121	NC_002528	AAT	2	6	4447	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616635
122	NC_002528	ATC	2	6	4478	4483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15616635
123	NC_002528	AT	3	6	4526	4531	50 %	50 %	0 %	0 %	15616636
124	NC_002528	ATTA	2	8	4559	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	15616636
125	NC_002528	AAGA	2	8	4567	4574	75 %	0 %	25 %	0 %	15616636
126	NC_002528	AATC	2	8	4596	4603	50 %	25 %	0 %	25 %	15616636
127	NC_002528	TAT	2	6	4619	4624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
128	NC_002528	TAT	2	6	4640	4645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
129	NC_002528	TAA	2	6	4697	4702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15616636
130	NC_002528	T	6	6	4835	4840	0 %	100 %	0 %	0 %	15616636
131	NC_002528	AGT	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
132	NC_002528	ATG	2	6	4897	4902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
133	NC_002528	T	7	7	4904	4910	0 %	100 %	0 %	0 %	15616636
134	NC_002528	AATT	2	8	5023	5030	50 %	50 %	0 %	0 %	15616636
135	NC_002528	ATT	2	6	5076	5081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
136	NC_002528	ATT	2	6	5142	5147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15616636
137	NC_002528	TGT	2	6	5150	5155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15616636
138	NC_002528	A	6	6	5157	5162	100 %	0 %	0 %	0 %	15616636
139	NC_002528	AGA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15616636
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141	NC_002528	TAG	3	9	5197	5205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15616636
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